生物科研人員發文章必不可少的就是對測序資料梳理整合,目前比較火爆的分析內容有關鍵基因篩選,基因家族分析,排名前十的GO註釋分類圖,特定功能相關基因的互作網路圖,多個分組共有差異基因通路展示,轉錄因子預測及功能分析等等。這些分析怎麼做?需要提供什麼資料?收費貴不貴?多久能拿到結果?我能不能自己做?

轉錄組資料分析

目前比較模式化,要想贏得審稿人青睞,必須要結合具體的科學問題做針對性展示。

轉錄組資料分析挖掘

幾步走?我們將眾多的分析內容歸納為4大類:所有基因挖掘、差異基因挖掘、表達量挖掘、高階工具挖掘。

1、所有基因挖掘

針對所有檢測到的基因,我們可以用基因名稱、功能註釋、序列資訊等進行檢索篩選;基於篩選的關鍵基因或者前期研究結果,重點關注某類基因家族,從序列資訊比對、功能結構域保守性分析、家族進化樹分析、表達模式分析等進行研究,進而解析基因家族與生物學性狀的關係。

2、差異基因挖掘

差異基因挖掘是基於差異基因篩選,實現不同分組間差異表達基因的比較、功能註釋和通路富集分析等,解析參與生物學過程的關鍵基因及其功能。

3、表達量挖掘

表達量挖掘可以根據各個基因的表達量,實現不同樣品中共同表達和特異表達的基因的篩選,如組織特有表達基因篩選、不同處理樣品間特異表達基因篩選、不同發育時期特異表達基因篩選等,並對特定基因進行後續功能分類分析,如聚類分析,表達模式分析等。

4、高階工具挖掘

高階工具挖掘主要是整合基因表達量與表型資料、互作資訊、其他組學資訊,進行基因共表達網路(WGCNA)、蛋白互作網路圖、組學聯合分析等,解析基礎代謝過程和轉錄調控網路。

如何快速高效的進行轉錄組資料分析?

針對上面這些分析內容,百邁客生物雲平臺免費開放了不限次的個性化挖掘和108款作圖小工具,一鍵出圖。百邁客雲於2014年5月正式開放,經過6年的打磨,轉錄組雲分析(次賬號)集結視覺化資料分析APP、個性化分析小工具、文獻檢索、公共資料庫、培訓影片,是科研工作者專案管理一站式平臺。在這個風起“雲”湧的時代,百邁客雲以快速、全面、透明的姿態全面起航。

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轉錄組資料分析與挖掘