今天是第一講，帶你走進R的世界。
R是用於統計計算和資料視覺化的免費且功能強大的程式語言。
R可用於計算各種經典的統計檢驗，以及各種最新的統計學建議方法。
以小編使用R近10年的經驗來看，論文中有什麼最新最高階統計學方法，99%都能找到相應的R軟體包或者功能實現。這不僅適用於我們平時對普通生物統計的需求，更是涵蓋了生物資訊學，高階統計學等對統計能力要求更高的學科。
使用R可以繪製許多型別的圖
，包括：箱形圖，直方圖，密度曲線，散點圖，線圖，條形圖，基本上論文上你能找到的圖，95%都可以透過R輕鬆繪出。解決了很多小夥伴想畫一個高階圖而不得的麻煩。
1. 用R的理由
1. 與SAS，SPSS，STATA比，R是開源的，免費的。
雖然小夥伴在市面上也可以獲得其他軟體的破解版，但是對於有些要求嚴格的雜誌來說，會要求作者出示軟體許可資訊。同時，使用破解版的軟體會對自己電腦的網路安全產生影響。
2. 透過將指令碼的方式，可以將結果嵌入單個檔案中，R可以實現快速重複相似分析。
比如導師要求你用四個不同的人群做同樣的分析，或者課題進展過程中因為一些小變動，圖、表或者分析需要重新做，擁有了R的指令碼程式碼備份，你只需要將初始的資料換成新資料即可輕鬆完成所有任務。
3. R是跨平臺相容的
因此可以安裝在Windows，MAC OSX和Linux上
4. R提供了多種統計技術和圖形功能。
5. R具有高度的可擴充套件性。
它具有成千上萬個有據可查的擴充套件軟體包（稱為R包），適用於金融部門，醫療保健等領域的廣泛應用。
大部分的分析，我們只需要使用特定
R包
的特點功能，就可以輕鬆實現。
同時，每一個R包及功能，都有質量可控的詳細介紹以及相關論文支撐。確保了其功能的準確可靠性。
2. R軟體的安裝
R軟體和其視覺化姐妹版Rstudio可以分別在其官網獲得。
R：https ：//
http：//
cran。r-project。org/
Rstudio：https ：//
http：//www。
rstudio。com/products/rs
tudio/download/
共同點：
都是是基於R語言對資料進行分析和作圖。
不同點：
R軟體完全免費，但是功能多樣性少。Rstudio在一定程度上將R軟體的很多內容做成了一個個視窗可視化了，比如設定工作路徑，檢視幫助，輸出圖表，快速查看錶格內容等。對於新手來說，更加容易上手。
雖然Rstudio它分為收費版和免費版，但我們使用免費版完全夠用了。
3. 執行RStudio以及設定工作目錄
R軟體
首次使用R時，在Windows和MAC OSX下的設定工作目錄過程如下：在“文件”資料夾中建立一個子目錄，例如R。R將使用此子資料夾（也稱為工作目錄）來讀取和儲存檔案。雙擊圖示啟動R。將工作目錄指定為R：在Windows上：File –> Change directory在MAC OSX上：Tools –> Change the working directory
Rstudio
（RStudio螢幕）
RStudio是一個四窗格工作區，用於
1）建立包含R指令碼的檔案，2）鍵入R命令，3）檢視命令歷史記錄，4）檢視繪圖等。
左上方面板：
程式碼編輯器，可用於建立和開啟包含R指令碼的檔案。R指令碼是記錄工作的地方。可以如下建立R指令碼：File –> New –> R Script。
左下面板：
用於輸入R命令的R控制檯
右上方面板：
工作區選項卡：顯示你在R會話期間建立的R物件的列表歷史記錄選項卡：顯示以前所有命令的歷史記錄
右下面板：
檔案選項卡：顯示工作目錄中的檔案繪圖選項卡：顯示你建立的繪圖的歷史記錄。在此選項卡中，你可以將繪圖匯出為PDF或影象檔案軟體包選項卡：顯示系統上可用的外部R軟體包。如果選中，則將程式包裝入R。
4. 更改工作目錄
你可以按以下方式更改工作目錄：在“文件”資料夾中建立一個名為“ R”的子目錄在RStudio中，使用選單在Session > Set Working Directory > Choose Directory目錄下更改你的工作目錄。選擇你在步驟1中剛剛建立的目錄也可以使用R函式setwd（），它代表“設定工作目錄”。比如在windows下，可以設定工作目錄如下：
setwd（“c：/Documents/my/working/directory”）
如果你想知道當前（或預設）的R工作目錄，請鍵入命令getwd（），該命令代表“獲取工作目錄”。
5. 設定預設工作目錄
每次開啟RStudio時，預設的工作目錄都是一個資料夾。你可以從RStudio選單下的預設工作目錄中更改：Tools –> Global options –> browser以選擇所需的預設工作目錄。關閉你的R / RStudio會話每次關閉R / RStudio時，系統都會詢問你是否要儲存R會話中的資料。如果決定儲存，資料將在以後的R會話中可直接使用。
✎ Tip
小編的建議是，儘量不要選擇儲存，因為這會佔用你很大的電腦記憶體。
在之後的更新中，我們會進一步為您介紹R的入門，以及常用生物統計方法和R實現。歡迎關注，投必得醫學手把手帶您走入R和生物統計的世界。
當然啦，R語言繪圖的掌握是在長期訓練中慢慢積累的。一個人學習太累，不妨加入“R與統計交流群”，和數百位碩博一起學習。
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