孔雀魚發情後,雌性腹部逐漸擴大,出現黑色斑點,雄性孔雀魚的臀鰭特化成生殖足,來供體內受精使用,雄魚這時會不斷追逐雌魚,與雌魚交配,雄魚的交界處會插入雌魚的洩殖腔中以排出精子並使體內受精,雌魚可以儲存精子供以後受精使用。當雌魚的胎斑變大變黑、肛門突出時,就可以進行分娩。
孔雀魚是雌魚和雄魚交配後胎生的。