如何分清PCR、qPCR、Real-time PCR、RT-PCR?BioArt2020-05-09 09:26:57

我們先來看一下PCR是什麼。

PCR是聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction)的簡稱。是一種分子生物學技術,用於擴增特定的DNA片段,可看作生物體外的特殊DNA複製。原理是利用DNA在體外95℃高溫時變性會變成單鏈,低溫(經常是60°C左右)時引物與單鏈按鹼基互補配對的原則結合,再調溫度至DNA聚合酶最適反應溫度(72°C左右),DNA聚合酶沿著磷酸到五碳糖(5‘-3’)的方向合成互補鏈。最有價值的應用領域就是對感染疾病的診斷。理論上,只要樣本有一個病原體存在,PCR就可以檢測到。

qPCR:

實現了DNA片段擴增後,如何進行

定量分析

呢?實時熒光定量PCR (Quantitative Real-time PCR,qPCR)是一種在DNA擴增反應中,以

熒光化學物質

測每次聚合酶鏈式反應(PCR)迴圈後產物總量的方法。用TaqMan探針法為例,將標記有熒光素的Taqman探針與模板DNA混合後,完成高溫變性,低溫復性,適溫延伸的熱迴圈,並遵守聚合酶鏈反應規律,與模板DNA互補配對的Taqman探針被切斷,熒光素遊離於反應體系中,在特定光激發下發出熒光,隨著迴圈次數的增加,被擴增的目的基因片段呈指數規律增長,透過實時檢測與之對應的隨擴增而變化熒光訊號強度,求得Ct值,同時利用數個已知模板濃度的標準品作對照,即可得出待測標本目的基因的複製數。

Real-time PCR:

Real-time PCR 與qPCR

基本相同,

是在PCR擴增過程中,透過熒光訊號,對PCR程序進行實時檢測。由於在PCR擴增的指數時期,模板的Ct值和該模板的起始複製數存線上性關係,所以成為定量的依據。

RT-PCR

逆轉錄PCR或者稱反轉錄PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR),是聚合酶鏈式反應(PCR)的一種廣泛應用的

變形,而不是Real-time PCR的縮寫

。在RT-PCR中,將 mRNA 反轉錄合成 cDNA 後再經 PCR 進行大量擴增,人們將這種偶聯稱為反轉錄聚合酶鏈式反應(RT-PCR)。RT-PCR

實質上是對 mRNA 的擴增

,我們常利用此技術克隆 cDNA或分析某一特異基因在組織細胞中的表達情況。